当然，比起原本应该存在上千种的过渡型化石数量而言，人类找到的已知化石看上去就比较少了。而且，客观而言，人类也不太可能收集到所有化石证据。因为，生物化石的形成本身就具有很大的偶然性，这会使得自然界中的化石记录并不会特别完整。而且，从间断平衡理论来看，那些在短时间内就完成物种进化的物种，是很难在这个过程中形成化石的。

而理论中存在的第二个问题，便与我们所生活的地球的年龄有关。在达尔文提出生物进化需要十多亿年时间的时候，当时的物理学家认为地球的历史都只有一亿年左右，而地球上有生命存在的时间更只有两千万年左右。当时的达尔文无法反击物理学家对其理论的质疑，只能将希望寄托于在以后的时间里，会有人计算出更大的地球年龄。

而事实也的确说明了，我们的地球其实已有